После 16-ой сессии Верховного Совета Таджикистана в ноябре 1992 года, которую многие называют "судьбоносной", и в которой Эмомали Рахмон пришел к власти, гражданская война в Таджикистана вспыхнула с новой силой. Правительство Таджикистана и Объединенная таджикская оппозиция (ОТО) под давлением мирового сообщества в 1997 году подписали соглашение о мире и национальной согласии в Таджикистане.

Эмомали Рахмон как глава Таджикистана назвал своей важнейшей задачей возвращение десятков тысяч беженцев из Афганистна и других соседних стран. В апреле 1994 года первая группа беженцев из Афганистана вернулась на родину.

После аннулирования договора о сотрудничестве с российской компанией РУСАЛ правительство Таджикистана в 2010 году возобновило строительство Рогунской ГЭС. Власти заявили, что достроят гидроэлектростанцию за счет местного бюджета. В 2010 году прошла масштабная акция по продаже акций Рогунской ГЭС. Реализация акций Рогуна была полностью прекращена после критики со стороны международных финансовых организаций. Первый агрегат Рогунской ГЭС заработал в 2018 году. Строительство гидроэлектростанции продолжается, найти средства на ее достройку становится все труднее, а население, тем временем, по-прежнему жалуется на "лимит" на подачу электроэнергии.

Таджикистан в январе 2011 года торжественно передал часть своей земли Китаю. Парламент Таджикистана ратифицировал протокол о демаркации своей границы, согласно которому Китаю перешли 1,1 тысячи квадратных километров спорных территорий. Решение о передаче земель Китаю, которое на официальном уровне называли «дипломатической победой», впоследствии стало одним из значительных поводов для критики режима.

В 1989 году в годы советской власти таджикский язык под давлением местной интеллигенции приобрел статус государственного языка. В статье 1 Закона "О языке" было отмечено: Государственным языком Республики Таджикистан является таджикский язык (фарси). В 2009 году при обсуждении проекта нового Закона "О государственном языке" депутаты парламента исключили из текста слово "фарси".

Правящий режим в Таджикистане критикуется за авторитарность и за то, что при назначении на ответственные должности предпочтение отдается не профессионализму и компетентности кадров, а лояльности и преданности главе государства. В Таджикистане действует клятва для чиновников. Она прописана в законе о государственной службе. Чиновники клянутся соблюдать законы, работать добросовестно и руководствоваться интересами государства и общества. Власти утверждают, что ответственные должности занимают опытные и компетентные профессионалы. Многим запомнилось высказывание Рахмона: "У меня нет в кармане кадров".

Конституция Таджикистана была принята 6 ноября 1994 года и за эти годы трижды подверглась изменениям. Власти говорят, что изменения в Основной закон призваны гарантировать лучшее соблюдение прав местного населения, однако критики властей утверждают, что изменения в Конституцию только укрепили власть президента Эмомали Рахмона. Международные организации называли всенародные референдумы по внесению поправок в Конституцию Таджикистана "непрозрачными" и "недемократическими".

Эмомали Рахмон в первые годы президентства выступал против культа личности. Однако он сам в 2016 году был провозглашен лидером нации "за выполнение исторической миссии спасителя". Согласно принятому закону, президент Эмомали Рахмон получает иммунитет от уголовного преследования, ему и его семье гарантируется неприкосновенность, жилье, пенсия и служебный транспорт, даже после того как он сложит с себя президентские полномочия.

Президент Таджикистана критикуется за предоставление льгот компаниям, которыми владеют его близкие родственники. Среди них - “Фароз”, “Сомон Эйр” и “Амири”. Эти компании являются монополистами в различных сферах и отраслях - от сбора ферулы до поставках ГСМ и гражданской авиации.

Власти Таджикистана после подписания Соглашения о мире национальном согласии в 1997 году в ходе нескольких спецопераций уничтожили некоторых бывших полевых командров "Народного фронта" и ОТО, других- приговорили к длительным срокам тюремного заключения. Политические оппоненты властей после "попытки мятежа" генерала Назарзода вынуждены были покинуть страну. Партия исламского возрождения Таджикистана (ПИВТ) - основная оппозиционная сила - была запрещена и объявлена террористической. Социал-демократическая партия Таджикистана после смены руководства прекратила критику режима.

Оппоненты критикуют Эмомали Рахмона за непотизм и монополию власти . У главы Таджикистана 7 дочерей и два сына. Старший сын президента Рустами Эмомали является спикером Маджлиси Миллии (верхней палаты парламента) и мэром Душанбе. Дочь президента - Озода Рахмон руководит исполнительным аппаратом главы государства. Другая дочь президента - Рухшона Эмомали в этом году была назначена послом Таджикистана в Великобритании и Северной Ирландии. Тахмина Рахмон, дочь президента, вместе со своим супругом Зарифбеком Давлатовым занимается бизнесом. Один из зятей главы Таджикистана - Ашрафджон Гулов работает послом Таджикистана в Турции. Один из племянников главы государства– Исломиддин Рахмон является председателем Дангаринского района, другой - Умед Рахмон прокурором района Сино города Душанбе.

Ежегодно сотни тысяч граждан Таджикистана из-за безработицы в стране вынуждены уехать на заработки в Россию, а также в Казахстан, США, Южную Корею и европейские страны. По данным российских властей, в этой стране находятся около 2 млн. мигрантов из Таджикистана. Власти Таджикистана заявляют, что в РФ работают 600 тыс. граждан страны.

В Таджикистане несколько компаний из КНР занимаются разработкой месторождений золота и серебра. Крупнейшая золотодобывающая компания Таджикистана – СП «Зарафшон» принадлежит китайской компании ZiJin Mining Group Co.Ltd, СП «Покруд» («Пакрут») - China Nonferrous Gold Limited (CNG), рудник «Якджилва» в Мургабском районе - «Каши Синьюй Дади Майнинг Инвестмент Лимитед»​. Китайская компания TBEA построила ЛЭП Юг – Север (500 кВ), Лолазор – Хатлон (220 кВ) и Худжанд – Айни (220 кВ). Эта компания получила также лицензию на разработку двух золотоносных месторождений в Айнинском районе Согдийской области – «Верхний Кумарг» и «Восточный Дуоба». Право на пользование рудниками китайской компании предоставлено для того, чтобы она смогла вернуть средства, потраченные на возведение ТЭЦ «Душанбе-2».

Филиал компании Innovative Road Solutions в Таджикистане с апреля 2010 занимается управлением автодорожной инфраструктурой Душанбе-Чанак на основе заключенной с правительством страны концессии. Оппоненты таджикских властей и жители неоднократно критиковали работу филиала компании IRS, отмечая, он не настолько хорош, чтобы за проезд брать деньги, тем более что автомобилисты и так платят транспортный налог. Компания Innovative Road Solutions была зарегистрирована в 2009 году в офшоре на Британских Виргинских островах. В документе имя таджикского владельца компании не указана. СМИ ранее писали, что владельцем филиала компании IRS в Таджикистане является Джамолиддин Нуралиев, зять президента Эмомали Рахмона. Однако сам Нуралиев отвергает эти утверждения.

С 90-х годов сотни тысяч квалифицированных специалистов - ученых, бизнесменов, учителей, медработников покинули Таджикистан. Только за последние два года уехали из страны или нашли себе другую работу около 15 тыс. учителей. Причин для "утечки мозгов" немало - низкая зарплата, отсутствие необходимых условий, давление со стороны властей и т.д.

США, ЕС, ООН, международные правозащитные организации критикуют Таджикистан за ограничения свободы слова, гражданских и религиозных свобод. За последние шесть лет несколько независимых СМИ были вынуждены прекратить свою работу. Не менее 7 журналистов и блогеров были задержаны, некоторые из них приговорены к длительным срокам заключения. Таджикистан покинули политические оппоненты властей.

В 2012 году пребывание российской военной базы в Таджикистане - крупнейшей за пределами России - было продлено до 2042 года. Военная база России - одно из самых мощных военных подразделений в Центральной Азии, которое было создана в 2004 году на основе 201-й мотострелковой дивизии, дислоцированной в Таджикистане в соответствии с договором о военной помощи. Власти Таджикистана заявляют, что присутствие РВБ необходимо для обеспечения безопасности страны и региона. Однако оппоненты считают присутствие российских военных - гарантией сохранения власти режима Эмомали Рахмона.

В ходе т.н. "контртеррористической операции" в Горно-Бадахшанской автономной области были ликвидированы некоторые неформальные лидеры региона. Местные жители считали их своими защитниками, власти - членами организованных преступных группировок. В ходе операции таджикских силовиков, по официальным данным, были убиты 29 человек, однако Радио Озоди удалось установить личности и составить список 34 погибших.

На строительство тоннеля «Истиклол» (Анзоб), который соединяет центральную часть Таджикистана с Согдийской областью, Иран потратил 61 млн долларов США. Строительство началось в 2003 году и завершилось в течение трех лет. Однако с самого начала буквально всплыли на поверхность «шероховатости» проекта. Водители и пассажиры постоянно жаловались на низкое качество дорожного полотна, приходившего в негодность из-за потоков прорывавшейся сверху воды. И только спустя 11 лет после сдачи в эксплуатацию тoннеля «Истиклол», Иран наконец-то завершил все необходимые ремонтно-восстановительные работы на объекте. Власти Таджикистана считают, что строительство этого тоннеля позволило стране выйти из коммуникационного тупика.

За 25 президентства Ислама Каримова отношения Ташкента и Душанбе оставились довольно натянутыми, а временами — открыто враждебными. Многие участки границы были заминированы с узбекской стороны, периодически мирные жители, в основном таджикские пастухи, подрывались на них. Власти Узбекистана прекратили железнодорожное движение на участке Галаба-Амузанг, что означало транспортную блокаду всего южного Таджикистана. Ташкент выступал не только против строительства Рогунской ГЭС, но и развернул масштабную кампания против Таджикской алюминиевой компании (ТАЛКО) и даже направил письмо в ООН об ухудшении экологической ситуации в приграничных с Таджикистаном районах. Глава Узбекистана Шавкат Мирзиёев после прихода к власти в конце 2016 года занялся «перезагрузкой» отношений с соседями по региону, особенно с Таджикистаном. При новом президенте все эти проблемы были решены за короткие сроки, был упрощен режим двусторонних поездок граждан двух стран, полностью убрали мины на приграничных территориях.​

По истечении всего лишь трех месяцев после прихода к власти Мирзиёева, возобновилось регулярное авиасообщение между Ташкентом и Душанбе. Летом 2018 года запустили регулярное автобусное сообщение из Душанбе в Денау и Термез, из Пенджикента — в Самарканд и из Худжанда — в Ташкент и Фергану.​

КОНФЛИКТ С КЫРГЫЗСТАНОМ

Таджикистан и Кыргызстан за почти 30 лет президентства Эмомали Рахмона так и не смогли решить проблему делимитации и демаркации границы. Протяженность границы между Таджикистаном и Кыргызстаном составляет 970 километров, из них уточнено всего 519 километров. Неуточненные участки становятся причиной стычек и конфликтов. В 2021 и 2022 г.г. на грание двух соседних стран произошли вооруженные столкновения, в результате которых с обеих сторон погибли сотни человек.

Власти Таджикистана, несмотря на строительство новых гидроэлектростанций, так и не решили проблему обеспечения населения электричеством. В 2017 году в стране впервые в осенне-зимнем периоде не был введен лимит на подачу электроэнергии. Компания «Барки точик» тогда сообщила, что за это время в стране были построены новые малые ГЭС и ТЭЦ, что позволяет перезимовать без лимита на электричество. Однако в Таджикистане периодически вводится лимит на подачу электроэнергии населению и каждый раз правительство заявляет, что вынуждено пойти на эту крайнюю меру, чтобы не допустить дефицит электроэнергии в осенне-зимний период.

Страны Запада и международные организации заявляют, что ни одни из выборов в Таджикистане не были демократическими, прозрачными и не соответствовали международным стандартам. Однако Россия, Китай и другие дружественные Таджикистану государства считают выборы и референдумы в стране демократическими.

Хиджаб и сатр - платок, завязанный спереди и прикрывающий грудь, в Таджикистане были объявлены чуждым национальным традициям и ценностям. В 2009 году в Таджикистане были установлены нормы бороды для мужчин, работающих учителями. Отращивать бороду позволялось преподавателям старше 50 лет, а ее длина не должна была превышать трех сантиметров. Между тем власти призывают жителей носить национальную одежду. Комиссия США по международным религиозным свободам (USCIRF) в ежегодных отчетах о свободе религий регулярно вносит Таджикистан в категорию серьезных нарушителей религиозных свобод.

Власти Таджикистана заявляют, что уровень бедности в стране снизился с 80 до 26 %, что является безусловным достижением. Однако, по словам оппонентов, большинство населения Таджикистана не имеет возможности заработать достаточно денег и обеспечить себя продуктами питания. Выжить им удается благодаря денежным переводам своих близких, работающих в России и других странах.

Половину населения Таджикистана составляют женщины и, по официальной статистике, около 30% руководящих должностей в госструктурах занимают представительницы прекрасного пола. Власти регулярно выделяют квоты на учебу девушек в вузах страны. За всю историю независимого Таджикистана лишь однажды, в 2013 году, кандидатом в президенты была выдвинута женщина – Ойнихол Бобоназарова, но и она снялась с президентской гонки.

В Таджикистане закон предусматривает смертную казнь, Однако в 2004 году на исполнение смертной казни был объявлен мораторий и с тех пор судьи в Таджикистане не приговаривают преступников к смертной казни, и с того времени в стране никто не был казнен. Как альтернатива смертной казни, в Таджикистане применяется пожизненное заключение. Приговоренные к пожизненному заключению не попадают под амнистию.​

Памятник основателю древнего таджикского государства Исмоилу Сомони был открыт в 1999 году в честь 1100-летия государства Саманидов. В годы советской власти во всех городах Таджикистана устанавливали памятники Ленину. После распада СССР в Таджикистане сносили почти все памятники вождю мирового пролетариата и вместо них начали устанавливать монументы в честь основателя государства Саманидов. Аналитик Абдумалик Кодиров в одной из бесед с Радио Озоди отметил, что все таджикские чиновники получали идеологическое воспитание в СССР и поэтому в независимом Таджикистане национальная идеология почти не отличается от советской.

В 1995 и в 1997 годах президент Эмомали Рахмон распорядился раздать плодородные участки бывших колхозов и совхозов гражданам для организации личных подсобных хозяйств. В те годы шла гражданская война и населению угрожал голод. Раздача около 75 тысяч гектаров пахотных земель должна была, по замыслу властей, помочь населению в послевоенные годы и вывести страну из продовольственного кризиса, что и было достигнуто.

В Таджикистане последние годы, наряду с древними праздниками Навруз, Мехргон и Сада, проводятся праздники дыни, меда, тыквы, винограда и картофели. Власти считают, что проведение этих праздников способствует равитию сельского хозяйства, однако их оппоненты убеждены, что чиновники таким образом стараются отвлечь внимание от насущных проблем.